职称：副教授
职务：
邮箱：1290zxnm@163.com 或 hongyi_liu@njfu.edu.cn
电话：
个人履历：
2014年6月毕业于浙江大学生态学专业，获理学博士学位。
2014年8月进入浙江大学医学院附属儿童医院工作。
2015年6月进入南京林业大学动物学系工作。
研究领域：
1. 围绕濒危动物的种群保护及复壮机制开展研究（主要研究对象为丹顶鹤）
1.1 丹顶鹤种群的遗传变异及其环境适应性
1.2 丹顶鹤的食性及其消化代谢特征
1.3 丹顶鹤的肠道菌群及其生理作用
2. 围绕大型土壤动物的分类进化及环境互作机制展开研究（主要研究对象为环节动物和节肢动物）
2.1 蚯蚓、马陆等大型土壤动物的系统分类
2.2 城市破碎生境对大型土壤动物种群及其遗传结构的影响
2.3 土壤理化因子与大型土壤动物的互作机制
讲授课程：
1. 本科生课程：《保护生物学》、《动物生理学》、《普通动物学》、《动物保护概论》、《动物与人类》
2. 研究生课程：《野生动物学》、《土壤动物学》
个人网站：
https://www.researchgate.net/profile/Hy-Liu-7
主持项目：
1. 盐城自然保护区越冬丹顶鹤食性动态及其肠道菌群适应性机理研究，国家自然科学基金，主持，2019.1-2021.12
2. 丹顶鹤MHC-II基因分离及其适应性变异研究，江苏省自然科学基金，主持，2016.7-2019.6
3. 丹顶鹤基因组物理图谱构建，浙江大学生命系统稳态与保护教育部重点实验室开放基金，主持，2019.2-2020.2
4. 基于GBS技术赤子爱胜蚓耐盐碱化的遗传机制研究, 江苏省博士后基金，主持，2019.7-2020.10
5. 基于MHC的丹顶鹤配偶选择研究，南京林业大学青年科技创新基金，主持，2017.1-2019.12
6. 基于全基因组揭示丹顶鹤长寿的秘密，南京林业大学标志性成果培育建设项目，主持，2021.6-2024.6
参与项目：
1. 基于肠道微生物研究两种入侵福寿螺快速适应环境变化的机制, 国家自然科学基金，参与，2022.1-2025.12
以第一作者发表论文：
1. Liu HY, Zhang YF, Xu W, Fang Y, Ruan HH*. Characterization of Five New Earthworm Mitogenomes (Oligochaeta: Lumbricidae): Mitochondrial Phylogeny of Lumbricidae. Diversity 2021, 13: 580.
2. Liu HY, He K, Ge YF, Wan QH, Fang SG*. Cape Feather Coloration Signals Different Genotypes of the Most Polymorphic MHC Locus in Male Golden Pheasants (Chrysolophus pictus). Animals 2021, 11: 276.
3. Hongyi Liu, Yunfeng Zhang, Guobing Wang, Jie Chen, Qingzheng Zhang, Honghua Ruan*. Development and characterization of microsatellite markers in the earthworm Drawida gisti Michaelsen, 1931 and cross-amplification in two other congeners. Molecular Biology Reports 2020, 47: 8265–8269.
4. Hongyi Liu, Chenghe Sun, Ying Zhu*, Yudong Li, Yisun Wei, Honghua Ruan*. Mitochondrial genomes of four American characins and phylogenetic relationships within the family Characidae (Teleostei: Characiformes). Gene 2020, 762: 145041.
5. Hongyi Liu, Nan Xu, Qingzheng Zhang, Guobing Wang, Hanmei Xu, Honghua Ruan*. Characterization of the complete mitochondrial genome of Drawida gisti (Metagynophora, Moniligastridae) and comparison with other Metagynophora species. Genomics 2020, 112: 3056-3064.
6. Hongyi Liu*, Chenghe Sun,Ying Zhu, Qingzheng Zhang. Complete mitogenomic and phylogenetic characteristics of the speckled wood-pigeon (Columba hodgsonii). Molecular Biology Reports 2020, 47: 3567–3576.
7. HY Liu*, QZ Zhang, CH Sun, N Xu, PX Chen, YF Ding. Development and characterization of 12 microsatellite markers for the roundtail paradisefish (Macropodus ocellatus) using RAD sequencing. Journal of Applied Ichthyology 2020, 36: 243-245.
8. Hongyi Liu, Zhiwei Chen, Ge Gao, Chenghe Sun, Yudong Li, Ying Zhu*. Characterization and comparison of gut microbiomes in nine species of parrots in captivity. Symbiosis 2019, 78: 241–250.
9. Hongyi Liu, Fei Xue, Jie Gong, Qiuhong Wan, Shengguo Fang*. Limited polymorphism of the functional MHC class II B gene in the black-spotted frog (Pelophylax nigromaculatus) identified by locus-specific genotyping. Ecology and Evolution 2017, 7: 9860-9868.
10. Hongyi Liu, Fei Xue, Qiuhong Wan, Yunfa Ge*. MHC Class II β Genes in the Endangered Hainan Eld’s Deer (Cervus eldi hainanus). Journal of Heredity 2013, 104: 874–880.
11. Hongyi Liu, Qiuhong Wan, Yunfa Ge*. Characterization of MHC class Ⅱ A genes in Hainan Eld’s deer（Cervus eldi hainanus）. Chinese Science Bulletin 2013, 58: 2148-2153.
12. 刘宏毅*, 孙成贺, 刘大伟, 鲁长虎, 吕士成. 两种鹤科动物MHC-Ⅰ基因高变区的对比分析. 动物学杂志 2019, 54: 567-575.
13. 刘宏毅, 黎明星, 肖俊，黄愉淋，张明*，甘西. 叉尾斗鱼遗传多样性的RAPD分析. 大连海洋大学学报 2012，27: 158-161.
14. 刘宏毅, 黎明星, 肖俊, 甘西，张明*. 基于Cyt b 基因序列研究5个地理种群叉尾斗鱼的遗传变异. 水生生物学报 2011, 35: 1038-1042.
以通讯作者发表论文：
1. Wang JC, Xu W, Liu YY, Bai YW, Liu HY*. Comparative mitochondrial genomics and phylogenetics for species of the snakehead genus Channa Scopoli, 1777 (Perciformes: Channidae). Gene 2023, 857: 147186.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
2. Ye WT#, Zhao XY#, Xu TJ, Wang JC, Liu HY*. Complete mitochondrial genomes of Lycosa grahami and Lycosa sp. (Araneae: Lycosidae): comparison within the family Lycosidae. International Journal of Tropical Insect Science. 2023, Published online.
3. Wei Xu, Jiachen Wang, Runfeng Xu, Haoming Jiang, Jiayu Ding, Han Wu, Yongbo Wu, Hongyi Liu*. Comparative mitochondrial genomics of tetras: insights into phylogenetic relationships in Characidae. Biologia 2022, 77: 2905–2914.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
4. Xu RF, Chen J, Pan Y, Wang JC, Chen L, Ruan HH, Wu YB, Xu HM, Wang GB, Liu HY*. Genetic Diversity and Population Structure of Spirobolus bungii as Revealed by Mitochondrial DNA Sequences. Insects 2022, 13: 729.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
5. Xinyi Zhao，Yifan Lu，Shiming Fan，Wei Xu，Jiachen Wang，Guobing Wang，Hongyi Liu*.The complete mitochondrial genome of Thereuopoda clunifera (Chilopoda: Scutigeridae) and phylogenetic implications within Chilopoda. 2022, Zootaxa 5174: 165-180.
6. Nan Xu#，Wentao Ye#, Chenghe Sun, Ke He, Ying Zhu, Hong Lan, Changhu Lu, Hongyi Liu*. Genetic Diversity and Differentiation of MHC Class I Genes in Red-Crowned Crane Populations. Frontiers in Ecology and Evolution 2022, 10: 898581.
7. Xinyi Zhao#, Wentao Ye#, Wei Xu, Nan Xu, Jiajun Zheng, Rong Chen, Hongyi Liu*. Changes in the Diversity and Composition of Gut Microbiota of Red-Crowned Cranes (Grus japonensis) after Avian Influenza Vaccine and Anthelmintic Treatment. Animals 2022, 12: 1183.
8. Jiayu Ding, Hong Lan, Wei Xu, Yining Chen, Han Wu, Haoming Jiang, Jiachen Wang, Yongbo Wu，Hongyi Liu*. Two complete mitochondrial genomes in Scolopendra and a comparative analysis of tRNA rearrangements in centipedes. Molecular Biology Reports 2022，49：6173–6180.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
9. Ye WT, Xu W, Xu N, Chen R, Lu CH, Liu HY*. Comprehensive transcriptome characterization of Grus japonensis using PacBio SMRT and Illumina sequencing. Scientific Reports 2021, 11: 23927.
10. Wei Xu, Shupeng Lin, Hongyi Liu*. Mitochondrial genomes of five Hyphessobrycon tetras and their phylogenetic implications. Ecology and Evolution 2021, 11: 12754-12764.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
11. Fang Yu, Chen Jie, Ruan Honghua, Xu Nan, Que Ziting, Liu Hongyi*. Genetic Diversity and Population Structure of Metaphire vulgaris Based on the Mitochondrial COI Gene and Microsatellites. Frontiers in Genetics 2021, 12: 686246.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
12. Xu N#, Ding JY#, Que ZT, Xu W, Ye WT, Liu HY*. The mitochondrial genome and phylogenetic characteristics of the Thick-billed Green-Pigeon, Treron curvirostra: the first sequence for the genus. ZooKeys 2021, 1041: 167-182.
13. Wei Xu#, Jiayu Ding#, Shupeng Lin, Runfeng Xu, Hongyi Liu*. Comparative mitogenomes of three species in Moenkhausia: Rare irregular gene rearrangement within Characidae, International Journal of Biological Macromolecules 2021, 183: 1079-1086.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
14. QZ Zhang, CH Sun, Y Zhu, N Xu, HY Liu*. Genetic diversity and structure of the round-tailed paradise fish (Macropodus ocellatus): Implications for population management. Global Ecology and Conservation 2020, 21: e00876.（蓝色：指导的本科生为第一作者）
15. Xu N, Chen YN, Zhang JM, Zhang QZ, Yang J, Li JJ, Liu HY*. Development and characterization of 33 SNP markers for the red-crowned crane (Grus japonensis) using a genotyping-by-sequencing approach. Conservation Genetics Resources 2020, 12:385-387.
获批发明专利：
1. 刘宏毅, 徐楠, 张清正, 陈奕凝, 张家铭. 一种丹顶鹤SNP标记及其筛选方法和应用, ZL201911068399.6
2. 刘宏毅, 孙成贺, 张清正, 徐楠. 圆尾斗鱼微卫星标记位点及其引物，ZL201910710663.5
3. 徐润枫, 刘宏毅, 许唯. 黑异纹魮脂鲤微卫星标记位点及其在本属和近源属鱼类通用性应用, ZL202110173358.4（蓝色：指导的本科生为第一发明人）
4. 王嘉陈，许唯，刘宏毅，卢轶凡. 一种检测霓虹脂鲤属下物种存在的环境DNA的方法, ZL202210484131.6（蓝色：指导的本科生为第一发明人）
指导研究生获奖：
1. 指导徐楠连续两次获研究生国家奖学金
2. 指导叶文涛获研究生国家奖学金
3. 协助指导孙成贺获研究生国家奖学金、南京林业大学校长奖学金
指导本科生获奖：
1. 指导张清正发表SCI一作论文两篇、获南京林业大学科技先进个人、南京林业大学优秀本科毕业论文
2. 指导方玉发表SCI一作论文一篇、获南京林业大学优秀毕业论文
3. 指导许唯发表SCI一作论文三篇、获南京林业大学科技先进个人
4. 指导丁佳钰发表SCI一作论文一篇
5. 指导徐润枫发表SCI一作论文一篇、以第一发明人获批国家发明专利一项
6. 指导王嘉陈发表SCI一作论文一篇、以第一发明人获批国家发明专利一项
7. 指导陈志伟、许唯、徐润枫、王嘉陈获国家级大创项目资助各一次、指导丁佳钰获省级大创项目资助一次
8. 指导脂鲤科鱼类研究小组（徐润枫、许唯、林舒芃、丁佳钰、王嘉陈）获全国大学生生命科学竞赛一等奖